Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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CNTN3Q9P232 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CNTN3Q9P232 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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