Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 WDR76-201ENST00000263795 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL365356.3-201ENST00000427341 657 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXQ1Q9C009 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms