Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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