Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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