Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
GRIK4Q16099 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms