Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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