Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PHACTR1-205ENST00000379350 4784 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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