Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SSPNQ14714 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SSPNQ14714 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms