Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms