Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms