Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 LINC00920-201ENST00000499966 2147 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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