Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RGPD3A6NKT7 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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