Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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