Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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TM6SF1Q9BZW5 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TM6SF1Q9BZW5 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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