Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CCDC93Q567U6 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms