Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
COL24A1Q17RW2 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms