Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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VPS72Q15906 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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VPS72Q15906 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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VPS72Q15906 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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VPS72Q15906 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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VPS72Q15906 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
VPS72Q15906 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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