Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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