Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms