Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CUL4BQ13620 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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