Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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BNIP1Q12981 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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BNIP1Q12981 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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BNIP1Q12981 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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BNIP1Q12981 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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BNIP1Q12981 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BNIP1Q12981 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BNIP1Q12981 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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