Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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