Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms