Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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