Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 U3.50-201ENST00000611947 228 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL359644.1-201ENST00000635872 471 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC078776.2-201ENST00000641021 285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PCDHGA10-201ENST00000398610 4617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NCMAP-201ENST00000374392 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 GLI1-208ENST00000546141 3475 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC01460-201ENST00000379677 2860 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NOD1-201ENST00000222823 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ARHGEF26-201ENST00000356448 5254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ABCG1-206ENST00000398457 3119 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC026801.3-201ENST00000606401 1565 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MAPK10-346ENST00000641737 2633 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF155-209ENST00000611002 2732 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 GRIK3-201ENST00000373091 9101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 EXOSC2-202ENST00000372351 1885 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL591222.1-201ENST00000568063 3844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KLHL3-201ENST00000309755 6806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KCNH5-203ENST00000394968 2490 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KRTDAP-201ENST00000338897 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 MT1P3-201ENST00000421424 177 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 C4orf51-201ENST00000438731 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC073626.2-201ENST00000449443 316 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 AP001208.2-201ENST00000519793 578 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ENPP7P8-203ENST00000529093 317 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HMGN2P46-208ENST00000598619 490 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 EDRF1-AS1-207ENST00000610534 706 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FTX_5.1-201ENST00000618701 218 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PKP4-218ENST00000629219 162 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FGFR2-209ENST00000369056 2650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 VTA1-203ENST00000452973 3177 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL008628.1-201ENST00000564198 5187 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LPA-203ENST00000614786 1713 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL596275.2-201ENST00000641749 1706 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF57-203ENST00000523428 1774 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FERMT2-205ENST00000553373 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MEIS2-211ENST00000559085 2538 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RHO-201ENST00000296271 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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