Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.08
PTPRMP28827 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PTPRMP28827 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms