Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HOXD10P28358 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXD10P28358 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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