Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BCL11BQ9C0K0 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 DYNLT1-202ENST00000367088 2891 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 DCAF5-208ENST00000556847 2791 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 DHRS9-201ENST00000357546 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 UGT2B4-206ENST00000512583 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 REG1CP-205ENST00000444841 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BCL11BQ9C0K0 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms