Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC002480.4-201ENST00000414116 2592 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 GRXCR1-201ENST00000399770 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 THAP12P3-201ENST00000456373 2266 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00943-203ENST00000535544 2815 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ADAM2-202ENST00000347580 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms