Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
UBXN4Q92575 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms