Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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