Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SH2D4B-202ENST00000339284 3983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC011297.1-201ENST00000620503 2110 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PPARGC1A-206ENST00000507380 2385 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TGM4-201ENST00000296125 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DCLRE1C-203ENST00000378242 1933 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL133384.2-201ENST00000623755 2954 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 JAZF1-AS1-202ENST00000444500 3684 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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