Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTP4A2Q12974 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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