Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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FOXC1Q12948 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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