Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPN13Q12923 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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