Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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PTPRGP23470 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPRGP23470 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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