Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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PTPRFP10586 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PTPRFP10586 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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