Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXA3O43365 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXA3O43365 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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