Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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C4orf47A7E2U8 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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C4orf47A7E2U8 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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C4orf47A7E2U8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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C4orf47A7E2U8 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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C4orf47A7E2U8 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
C4orf47A7E2U8 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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