Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SMG9Q9H0W8 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SMG9Q9H0W8 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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