Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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NRF1Q16656 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NRF1Q16656 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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