Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXO1Q12778 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms