Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD10P28358 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms