Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPREP23469 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPREP23469 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PTPREP23469 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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PTPREP23469 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPREP23469 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPREP23469 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPREP23469 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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