Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TACR1-201ENST00000305249 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC132825.3-201ENST00000562182 4710 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PKHD1P08F94 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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