Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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LINC00587B1AMM8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
LINC00587B1AMM8 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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