Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC005387.1-201ENST00000597837 352 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 VIT-203ENST00000389975 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CPEB1-AS1-202ENST00000618020 2994 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ERVV-2-201ENST00000601417 2431 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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