Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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SAMD8Q96LT4 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SAMD8Q96LT4 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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