Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms