Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
NEDD1Q8NHV4 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms